[郭志鴻/賴爾珉] 農桿菌(Agrobacterium tumefaciens)Ach5菌株之全基因體定序

農桿菌(Agrobacterium tumefaciens)是生活在土壤裡的一種植物病原菌。有些菌株具有一個能誘發腫瘤(Ti)的質體,內含可被轉移並結合到宿主植物基因組的DNA(Transferred DNA; T-DNA)。這些菌株會使許多雙子葉植物產生冠瘤,而在遺傳工程學上則常被用在植物的基因轉殖實驗上。Ach5菌株起初分離自菊科蓍屬植物之冠瘤。此菌株帶有一個octopine型的Ti質體,能在許多木本植物、菸草、及蕃茄上誘發冠瘤,而其衍生菌株中有數個被廣泛應用在植物基因轉殖實驗上。為增進對此菌株的了解並協助其相關研究工作,本所郭志鴻賴爾珉研究室合作完成此菌株之全基因體定序。Ach5菌株之基因體包含一條環狀染色體(長度為2,833,887 bp)、一條線性染色體(2,095,752 bp)、 一個大質體(544,752 bp)、及一個Ti質體(194,264 bp)。 基因註解包含有15個核糖體RNA、56個轉移RNA、以及5,276個蛋白質編碼基因。

本論文第一作者黃雅怡博士為中央研究院植物暨微生物學研究所博士後研究員,研究經費由中央研究院所提供。

Huang YY, Cho ST, Lo WS, Wang YC, Lai EM, Kuo CH* (2015) Complete genome sequence of Agrobacterium tumefaciens Ach5. Genome Announcements 3: e00570-15. DOI: 10.1128/genomeA.00570-15