[邢禹依] 自然漸滲可能造成T-DNA突變系外表型的誤判

為何水稻突變族群的被標記率很低?我們以TRIM為材料做了一系列的分析。田間的花粉汙染即使在水稻這種自交作物也會發生,花粉貢獻親透過雜交混入樣本個體中,是為漸滲 (introgression)。若它發生在誘變系或轉殖系田裡,因為會出現突變系型態,而被誤認為是突變造成,此時就必須透過分子生物的技術確認。本研究提出兩個例子,皆利用全基因組序列比對的方式,定出來自花粉源貢獻親的區段,同時在其中一個米粒長度過長的突變後代中,透過類MutMap+的方法,定位得知造成此長榖粒的主要基因是GS3,也位在漸滲的區段。而這兩個例子的花粉貢獻者雖然不一,但基於親緣關係分析,兩者都來自於與原材料粳稻相異的籼稻。(Wei et al., 2016, PloS One)