[施臥虎] 歧異性的基因共同表現網絡分析

適應特定環境過程時成百上千個基因的表現有改變,其中關鍵基因的鑑定是一項具有挑戰性的任務。為了剖析缺磷處理下誘導根毛的型態的相關基因,施臥虎的實驗團隊 建 立了缺磷處理下共同表現 基因之間的聯絡網以集結了各種實驗而客製化的資料庫為背景,根毛發展時   其中表現有差異的基因轉譯出已確認功能的蛋白被超限 額,並解整合此分析程序到從被挑選出之基因的啟動子中尋找普遍存在的調控序列。這種研究方法揭露在磷缺乏時誘導根毛的形成時新的生物學觀點,包括細胞週期 的控制、質體到細胞核的訊息傳導、病菌的防禦、細胞壁相關的碳水化合物代謝的重新編程和染色質體的重新組裝。(Scientific Reports)。我們與生物資訊核心實驗室合作開發的實驗方法適合用來分析鑑定不同濃度磷的供給下的功能的分子和大量轉錄時相關基因表現有些微改變的基因。