生物資訊核心實驗室是設立於2007年初。本實驗室擁有兩台穩健，高可用度的電腦叢集系統做為高效能電腦運算平台。一台是8個節點的PC LINUX CLUSTER，而另一台則是蘋果電腦叢集，由12台蘋果Xserve伺服器等級電腦所組成。透過高效能運算硬體配備，本實驗室可提供生物資訊運算服務：使用基於統計，數學及資料探勘理論所發展出來的軟體工具，廣泛地應用在生物相關的研究及應用上，如基因及蛋白質序列分析，微陣列分析及親緣分析等等。本實驗室也為本所提供生物資訊相關諮詢及教育訓練服務。
委員會委員：
- 涂世隆博士
- 施臥虎博士
- 吳素幸博士
- 賴爾珉博士
- 邢禹依博士
研究助技師：
詹佳翰博士
助理：安明信、潘昭宇
設備：
LINUX 電腦叢集 (8個節點)
蘋果電腦叢集 (12個節點)
軟體：
MPIBLAST (平行處理)
CLUSTAL-MPI (平行處理)
HMMER-PVM (平行處理)
PHYLIP
CLUSTALW
T-COFFEE
GLIMMER
EMBOSS
PyMol
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